Jean-François Cautain possède une vaste expérience professionnelle dans le domaine des relations extérieures. Ses principaux domaines d’expertise recouvrent l’analyse et le dialogue politiques, les situations d’après-conflit, la coopération internationale et l’aide aux pays en voie de développement. Il a été en mission en Afghanistan et au Pakistan pendant 15 ans.
Jean-François Cautain a œuvré pendant plus de 16 ans comme directeur d’ONG internationales tant aux sièges que sur le terrain. Il se rend en Afghanistan à plusieurs reprises entre 1986 et 1992 et il est affecté à Jalalabad de 1994 à 1999. En 2001, il rejoint le bureau technique de la Commission européenne à Peshawar en tant que responsable des opérations afghanes. En 2002, à Kaboul, il devient membre de la délégation nouvellement créée de la Commission européenne en Afghanistan. En 2003, il est Chef de la coopération de la Commission européenne en Afghanistan jusqu’en 2005.
De 2005 à 2009, Jean-François Cautain est Chef de la section politique, presse et information de la délégation de la Commission européenne en Thaïlande pour laquelle il est chargé du dialogue politique entre le gouvernement thaïlandais et les différentes parties prenantes au Myanmar.
Après la ratification du traité de Lisbonne en 2010 et 2011, Jean-François Cautain contribue activement à la mise en place du Service européen d’action extérieure, pour lequel il est nommé directeur d’équipe au service de la coordination politique à Bruxelles.
En novembre 2011, il devient le premier ambassadeur résident de l’Union européenne auprès du Royaume du Cambodge. En octobre 2014, il devient le doyen du corps diplomatique.
De septembre 2015 à août 2019, il est ambassadeur de l’Union européenne auprès de la République islamique du Pakistan.
Il est actuellement conseiller auprès de la Direction de l’approche intégrée pour la sécurité et la paix au sein du Service européen pour l’action extérieure. A ce titre, il se rend, en mars 2021, à Doha, afin de rencontrer les deux équipes de négociateurs afghans.
Jean-François Cautain est titulaire d’un master en gestion du développement de la London School of Economics et d’un doctorat en médecine vétérinaire.
Jean-François Cautain est marié et père de deux enfants.